La transformación digital del sistema judicial peruano, lejos de limitarse a la incorporación de herramientas tecnológicas, configura un proceso de reconfiguración institucional cuya complejidad se manifiesta en la tensión constante entre innovación normativa, dinámicas organizacionales heredadas y condicionamientos sociopolíticos específicos. A través del estudio del Expediente Judicial Electrónico (EJE), se examinan críticamente las trayectorias de implementación tecnológica y los marcos institucionales que interactúan con las políticas de digitalización, identificando patrones de fragmentación estructural que desafían los supuestos de eficiencia y modernización frecuentemente asociados a estos procesos. Los hallazgos apuntan a una digitalización paradójica, donde la proliferación de iniciativas aisladas, la desarticulación entre actores institucionales, las debilidades en ciberseguridad y la persistencia de marcos normativos precarios configuran un escenario de vulnerabilidad estructural. En este contexto, se observa cómo las tensiones entre diseño formal y prácticas cotidianas reflejan no solo resistencias organizacionales, sino también una fragilidad de la arquitectura institucional que sostiene el proceso. Lejos de constituir una narrativa de éxito lineal, la experiencia peruana revela una modernización fragmentada en el que los avances técnicos coexisten con déficits de legitimidad, sostenibilidad y equidad, poniendo de relieve la necesidad de un enfoque sistémico que trascienda lo meramente instrumental e integre dimensiones de gobernanza, justicia social y resiliencia institucional.